Если организация использует воду для разведения аквакультуры (в том числе рыб), то весь объем воды не облагается водным налогом
Письмо ФНС России от 22.08.2022 N СД-4-3/10965@
При фактическом использовании организацией забранной воды в рамках ведения деятельности, связанной с разведением и (или) содержанием, выращиванием объектов аквакультуры, объем воды, использованный на указанные цели, не облагается водным налогом независимо от целевого назначения забора воды, указанного в лицензии на право пользования недрами.
При использовании воды на основании одного разрешительного документа в нескольких целях следует вести раздельный учет забранной из водного объекта воды.
Если раздельный учёт забранной из водоема воды по целям ее дальнейшего использования не ведется, тогда весь объем забранной воды облагается водным налогом по общим ставкам и в порядке, установленном статьей 333.12 НК РФ.
Данная позиция согласована с Минфином России, письмо от 11.08.2022 N 03-06-05-02/77962.